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php源码就是用php语言写出来的程序，mysql只一种关系数据库和sqlserver，access类似的东西。弱弱的问一句，你不是学编程的问这个干什么?
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PHP 一种网页编写语言
数据库 一般是ACC MSSQL MYSQL PHP一般采用MYSQL数据库
SESSION 能使全局变量应用在每一个PHP页面上 比如用户在你的网站首页Index.php 登录了用户名{user}（这是个假设） 然后他点击你网页上的链接进入子栏目时则会重新与服务器链接 本来登录了的用户名{user}没有应用到这个子栏目中 结果导致用户又回到了未登录状态
----至少我是这样理解的-----
COOKEI 网站会保存在用户本地一些COOKEI信息 以记录状态 比如你登录一些论坛 点击一下保存用户名 下次进入这个论坛时 你的用户名会自动显示在用户名一栏中（举例稍微简单了点哈）
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以上废话连篇 其实我也是初学者 所以我建议这位仁兄如果想学建站的话 既然又有HTML基础 不如先学习ASP吧 PHP较适合开发一些大型网站呐。
PHP是逻辑语言，数据库是存放信息的。PHP通过逻辑去数据库调用客户想看的数据。
这个问题问得有点模糊，什么叫PHP数据库？应该是PHP操作数据库吧。如果是说PHP操作数据库的话，那你应该了解如下内容：
1、市面上有哪些数据库。市面上有很多数据库，既有SQL型的数据库，如MySql、SQLSever，也有Nosql型数据库，如Redis、Mongodb
2、PHP可以操作哪些数据库。PHP基本上可以操作市面上的所有数据库。
3、PHP是如何操作数据库的。PHP操作数据库是有两种方式，一种是使用PHP中对应数据库的扩展，如操作mysql，PHP可以使用Mysqli扩展；另一种是使用PDO扩展和对应的数据库驱动。
4、这些数据库扩展如何安装启动的。通常一些常见的数据库的扩展PHP源码是有包含的，如PDO、MySql，所以像这种你只需要在安装PHP时，通过设置几个参数来启用就好，但像Redis、Mongodb等这些PHP源码里没有包含，所以在安装好PHP后，你需要先下载这些扩展，然后编译，最后在php.ini文件里开启。
5、如何使用PHP代码操作这些数据库。在安装好对应的扩展后，你基本上就可以使用PHP代码操作数据库了，如连接数据库、执行数据库操作、关闭数据库，但具体怎么写，可以参考对应扩展的开发文档，一般文档都有明确说明。
了解了以上几点，你就可以使用PHP操作数据库了