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这主要通过书面的和实际的比较分析后得出。其实际内容主要是三项:系统功能，各项指标及用户满意程度。
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前两项一般在系统开发各阶段都明确定书面要求。在用户需求调查、需求分析、系统总体设计、详细设计、合同协议等文件中对功能及指标均有相应规定，在罗列及对比后，应予必须的分析。
用户的满意程度在系统评价中往往是一个争议较多的问题，只有在开发方和用户方共同实事求是，平等协商下才能取得较好的解决。
作为GIS系统的建设者的开发方应主动地担负重要的责任，明确GIS是理论和实践相结合的产物，是一个只有在应用中才能体现价值的应用系统，用户至上是一切产品和信息系统的开发原则;而另一方面，对用户而言，又必须明确GIS是一个尚待理论和实践不断完善和补充的高技术系统，它发展很快，一劳永逸是不可能的，有限目标的应用才是现实的。
有几个比较重要的指标一定要用到，坡度、起伏度、高程、土地利用类型，然后就要考虑外界负面影响因素了，比如周边道路的噪声影响、工业区。再考虑外界正面影响因素，如距离公园、学校、医院、商场、车站等便民设施位置，另外可以加上部分地域特色指标进行考量。
GIS技术可以为多种来源的空间信息数据采集提供地学知识与处理。空间数据是指描述“空间实体”的空间位置特征与专题属性的数据，通常包括不同来源和形式的遥感数据、地形图数据、专题图数据、野外采样数据、统计调查数据等。
广西壮族自治区农用地分等是在掌握全自治区农用地数量与分布的基础上，借助于地理信息系统和计算机技术，对农用地的质量进行全面、科学、综合的评价，为提高农用地管理提供依据。工作中主要利用MapGIS软件强大的图形编辑功能、数据库管理功能和空间分析功能，科学量化农用地数量、质量和分布，形成数字化的各类农用地分等工作底图，对全自治区农用地进行综合分析、评价，提高了分等结果的准确性和精确性。广西壮族自治区农用地分等采用的信息系统是以MapGIS软件为基础平台，结合Excel电子表格和Access数据库等软件，根据该自治区农用地分等的技术路线，对MapGIS软件进行局部的二级开发，保证了广西壮族自治区农用地分等信息系统的结构完整和功能齐全，建库方便、快捷。
（一）资料整理与图件准备
将资料整理录入计算机，对资料数据进行综合核实，剔除不符合实际的特殊的极值，为入库做好准备。图件的准备工作包括工作底图的准备和其他专业要素图件的准备。图件比例尺要满足农用地分等精度要求，图上内容要素齐全、图面清晰，满足扫描矢量化要求。
（二）工作底图的入库（数字化）
具体工作过程中，采用各县（市、区）1∶5万～1∶10万的土地利用现状图作为工作底图，用扫描仪将工作底图资料进行灰度扫描，以栅格形式存贮于图像文件中（例如TIFF格式），在MapGIS软件编辑功能下，经过图像黑白转换，进行矢量化，转换成矢量数据，把点、线分层存入，成为线文件或点文件，再进行点、线、面的编辑，然后把编辑好的图形文件进行光栅处理，输出图件校对。其中，图形编辑包括对点、线、面3种图元的空间数据和图形属性进行编辑。首先，对已经矢量化好的图形文件（线文件或点文件）进行参数设置（即分层设置、线形设置、符号设置、区颜色设置），编辑点、线属性结构；然后，对图形数据进行自动拓扑处理，经过建立拓扑关系的图形，每个区域赋予属性并自动控制为区域填色。根据图件的用途，可以更改区域参数及属性。
（三）分等单元图的编制
根据分等评价单元的基本要求和单元划分时应遵循的原则，结合广西壮族自治区区域内地貌类型多样、地形复杂、土壤类型异常明显，呈垂直分带性、农用地分布零碎等特点，采用叠置法将同比例尺的土地利用现状图（工作底图）与地形图、土壤图叠加，手工划分分等评价单元，并按行政区划编号。
在已经编制好的各县（市、区）分等评价单元图上，进行农用地分等单元图数字化，即将划分好的分等评价单元的手工图作为作者原图，在已经数字化的同比例尺土地利用现状图上，采用MapGIS在图上进行点图元编辑。然后，在图形编辑菜单中打开区属性编辑栏，根据单元编号所在的区域（即面域），输入单元编号，编辑单元区属性（即分等单元属性编辑），使单元编号成为图、表链接的关键字段，完成分等单元图件数字化。
（四）编制单元因素分值
以手工划分的分等评价单元图为工作底图，按照广西壮族自治区农用地分等所确定的分等因素图逐一套合分等评价单元，读出该评价单元所应有的因素分值，即计算单元因素分值，对照“指定作物－分等因素－自然质量分”关系表，将分等因素分值转换成分等因素自然质量分，再把各分等评价单元的自然质量分录入计算机，编制分等单元分等因素自然质量分值表。
（五）分等评价单元的自然属性和经济属性入库
将分等评价单元自然质量分值表以Excel格式录入计算机，成为电子表格文件，即分等评价单元的自然属性入库。分等评价单元的经济属性指单元的土地利用系数和土地经济系数，是将有关资料在电子表格上按指标区进行汇总计算得出，根据规程要求划分土地利用等值区和土地经济等值区，将各分等评价单元所处的土地利用等值区的值与土地经济等值区的值读出并录入分等评价单元自然属性表，再在计算机上对电子表格进行分析，计算出各类等指数，完成分等评价单元的自然属性和经济属性入库，把Excel电子表转到数据库存为DBASE格式文件。
（六）建立农用地分等数据库
将编辑好的分等单元图形属性的数据文件与数据库中的分等单元自然属性和经济属性质量分值电子表（DBASE格式）数据文件，根据关键属性字段（分等单元编号）挂接，即把已经存在的图形属性信息和空间数据库中的自然属性和经济属性信息用关键字段链接起来，使图、表合一，成为统一的空间数据库。这样建立起来的农用地分等数据库，可以把图形属性数据和空间属性数据库的采集并行，便于图、表的修改，即对表格进行修改，就能使图形自动完成更改，提高成图的工作效率和精度。在计算机系统软件属性管理菜单中，根据属性赋参数栏，对各种农用地分等因素值、分等指数参数值规定一定范围域，给范围域设置颜色参数，完成颜色参数设置后，农用地分等信息系统自动给数据图形的值域赋予颜色，进行农用地的各种因素图件和等别图件的制作，并根据系统内的条件生成点文件，把区域属性转换成等别号，图形上注解等级信息，由此完成广西壮族自治区农用地分等数据库的建立。
（七）农用地等别面积的汇总统计
根据等别图图形属性数据文件，在MapGIS软件实用服务功能上，打开投影变换菜单，点击工具栏，在属性生成文件文本目录下，打开图元文件，由图形属性库（各单元图形属性）生成文件，存为TXT格式的报表文件，再由TXT文件转为Excel电子表格，进行分等面积汇总。由图形属性文件转换成的Excel电子表格文件，保留了农用地各单元的属性，例如，乡（镇）、村、地类号、单元号、等别、面积等。在此基础上分村汇总等别面积，并结合各县（市、区）土地利用现状变更台账数据，进行单元面积平差。经过平差的农用地单元面积，分村、乡（镇）、县（市、区）、全自治区4级，在计算机上进行等别面积汇总统计。
一、信息系统的评价内容:
1、技术上的评价内容主要是系统性能，具体内容为:
(1)信息系统的总体水平。
(2)系统功能的范围与层次。
(3)信息资源开发与利用的范围与深度。
(4)系统的质量。
(5)系统的安全与保密性。
(6)系统文档的完备性。
2、在经济上的评价内容主要是系统的效果和效益，包括直接的与间接的两个方面。
(1)直接的评价内容有：
①系统的投资额。
②系统运行费用。
③系统运行所带来的新增效益。
④投资回收期。
(2)间接的评价内容有：
①对企业形象的改观、员工素质的提高所起的作用。
②对企业的体制与组织机构的改革、管理流程的优化所起的作用。
③对企业各部门间、人员间协作精神的加强所起的作用.
二、信息系统的评价指标:
采用层次分析法建立的信息系统价值评估模型，在信息系统评价指标中包括：定量指标，即投入指标和产出指标；定性指标，即宏观和微观指标。
1．定量指标
分析定量指标可以按传统的模式，广义的信息系统的投资回报可以简单写成： ROI＝(成本降低十收入增长)／总成本
(1)投入指标(总成本)
1)系统分析设计费用和实施费用，包括硬件、软件和人员消耗费用等。
2)人力成本，包括人员重新招聘、人员重新部署和人员培训的费用。
3)流程成本，这也是很重要的。因为部署信息系统的企业需要对现有的工作流程进行改造。
4)系统运行成本，诸如集成和测试费用、运行费用、管理费用、数据分析成本、数据转换成本等。
5)信息系统的维护和持续改进费用。
6)机会成本。例如，企业由于选用其中某一家厂商的管理软件系统，而放弃了其他厂商所能够带来的机会效益，就是一种典型的机会成本。
(2)产出指标
产出指标主要包括收入增加和成本降低。
2．定性指标
(1)宏观指标
1)企业的经济效益和竞争力是否提高了。如果将其转变为具体的经济指标，可以分为利润率、成本费用利润率、流动资金周转率、存货周转率、全员劳动生产率、计划执行准确率、设备利用率、市场信息准确率、客户满意率、交货准时率、产品优质率等。 2)管理模式、组织结构和业务流程是否有所创新。
(2)微观指标
1)信息系统的应用广度和深度，包括系统的用户数量、用户的职位、系统信息数量、业务信息数量等。
2)信息系统对资源的开发率和利用率。如果把OA信息系统比作人体骨骼的话，信息资源就是肌肉和血液。从信息资源开发利用角度，可以评价信息系统的利用程度和企业的知识管理水平。这可以从挖潜能力以及信息的收集、加工和共享方面进行评估。
3)企业的业务流程、工作流程是否发生了实质性的变化。
4)员工素质的提高和员工参与信息化的程度。人力资源是企业信息化的重要组成部分，也是信息化的参与者，即信息化的主体。在这里，人力资源包括信息技术人员和企业的其他员工。对于前者的评价，主要考察其计算机应用能力、软件设计开发能力以及理论和实践相结合的能力；而对后者，由于企业信息化的深入，员工积累了丰富的经验和教训，这是推动企业信息化的基础。
5)是否改善员工工作满意度。
6)企业不同部分之间是否拥有统一的基础数据环境，以及能否实现协同工作流。