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this.close() 只是关掉，没有释放，不对 me.close() 应该释放一下 me.Dispose() 给分吧、
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无代码无真相！
话说，应该看你这个实例a是作用域的变量，如果仅仅是在函数A中定义的局部变量，那么应该会在函数运行完成的时候自动销毁的。这个应该是变量的生存期问题。
但是，根据你所提供的描述来看，你的这个a类应该定义的至少是一个是模块级别的变量，不然，你在函数B中，用另一个b类来引用a实例是无法实现的。因此，我感觉函数A运行完了之后，你的a实例应该并没有销毁，只有等到整个模块被结束的时候才能销毁。
(PS: VB.net没有用过，以上仅仅是基于vb6.0的类模块使用方法所提出的一点参考建议！)
工程的启动界面你设成welcome.vb了吧，把它换成login.vb的窗口，从login.vb的窗口中调用welcome.vb，然后这个me.close()应该就能好使了
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挺长时间没用VB.NET了，在你设置完启动界面为login后，进入login的代码处，在 Public Class Form1下敲入Sub New()也就是初始化。在那里面写入调用welcome的窗口程序
Dim frm as New welcome，
还要写一个判断
if frm.showDialog=Windows.Forms.DialogResult.Cancel
(里面随你以后工程需要自己添加)
end if
这样你在welcome里面用timer控制关闭的时候就可以写me.close（）了。 不知道楼主明不明白......
清空所有窗口的话，直接就是把所有的东西都划掉就可以了，很简单的。
子窗体名.Close()
或
子窗体名.Dispose()
后者连同窗体内的对象一起销毁。
要在VB.NET中清屏已经不再是象是在VB6中那么简单使用一条Cls就能搞定的,因为现在的VB.NET已经是完全面向对象的语言了,方法就不能和以前那样了,下面给出清空窗体的源代码,通过单击按钮清空,如下:
Private Sub Button1_Click(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles Button1.Click
Dim g As Graphics
g = Me.CreateGraphics
g.Clear(Me.BackColor)
g.Dispose()
'释放对象g所占用的资源
End Sub
OK,程序已经成功实现你要的功能,运行环境VS.NET2003+Windows 2003 Server
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