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显然，你要靠php操作其范围外的文件或目录是不可能的，这是因为php的运行身份是apache，因此没办法操作root权限的文件或目录。
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我们采取的办法是，用VC写个服务，该服务的运行身份是root，也就是给其最大权限，php调用该服务做操作。
当然还有另外的办法，这是我的猜测，你不妨试看看，
1、把php的运行用户改为root，这样可能会存在一定的风险。
2、在apache里面指定可以对某个root权限的文件或目录做操作，该办法没试验过。如果你能试验成功的话，希望反馈一下哦。
我们的服务器是这样做的：
php一般是以apache用户身份去执行的，把apache加入到存储你文件的父文件夹属组里去，然后改该父文件夹权限为775，这样属组成员就有写的权限，而apache属于这个组就可以改写该目录下所有文件的权限，当然，属组最好不要是root，你可以为该文件夹改个其它普通用户组。
改apache/php的运行用户方法不安全，不建议使用。
你想问得是php如何执行shell命令把？
可以用system(),exec(),passthru()这三个函数实现
虽然这三个命令都能执行linux系统的shell命令，但是其实他们是有区别的：
system() 输出并返回最后一行shell结果。
exec() 不输出结果，返回最后一行shell结果，所有结果可以保存到一个返回的数组里面。
passthru() 只调用命令，把命令的运行结果原样地直接输出到标准输出设备上。
相同点：都可以获得命令执行的状态码
例子：system("ls -al");
【使用之前要在php.ini中把safe_mode关闭】
php执行linux的命令用system或exec就可以，只要打开safemode，但是一些系统底层的没有执行命令的不允许调用哦，实在有些命令例如zip之类想用的话，直接用php写入一个shell脚本文件再exec那个sh就好了。
PHP 中执行系统命令有几种方式：
system()：和 C 语言中的 system() 函数的用法是一样的，参数为命令行，成功则返回命令输出的最后一行，失败则返回 FALSE。
shell_exec()：执行命令，然后返回命令执行后的 stdout 输出。
passthru()：直接执行命令，然后将输出内容直接显示到网页上。
在这里，curl 的输出不用显示到网页上，所以 system() 可能比较合适。