R语言ggplot2怎样画热图添加分组信息的颜色条

 

之前有人在公众号留言问文章开头这幅图如何实现，下面的B图是折线图加柱形图，相对比较容易实现，上面的A图稍微有点复杂，我想到的办法是拼图，图A可以看成三个热图，然后加一个堆积柱形图，最后将四个图组合到一起。那就按照这个思路试一下看能不能实现。

最初的想法是左侧的颜色条用堆积柱形图来实现，又看了一遍Y叔公众号关于aplot这个包的推文，发现他是用geom_tile()函数实现的，仔细想想还是geom_tile()函数实现起来比较方便。

非常感谢下面这位的留言

文本添加下划线的小例子

df<-data.frame(A=1:10,
               B=1:10)
library(ggplot2)
ggplot(df,aes(A,B))+
  geom_point(size=5)+
  theme_minimal()+
  ggtitle(expression(underline("Good Good Study, Day Day Up")))+
  labs(x=expression(paste(italic("ABC"),"123")))

 

下面进入今天推文的正式内容

 

如何画这个热图昨天的推文已经介绍过了，点击下方蓝色字可以直达昨天的推文

R语言ggplot2画带有空白格的热图简单小例子

 

df2<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap_color_bar.csv",header=T)
df2$y<-factor(df2$y,levels = rev(df2$y))
ggplot(df2,aes(x=x,y=y))+
  geom_tile(aes(fill=group))+
  scale_x_continuous(expand = c(0,0))+
  theme(panel.background = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank(),
        axis.title = element_blank(),
        axis.text.x = element_blank(),
        legend.position = "left",
        legend.title = element_blank())+
  scale_fill_manual(values = c("green","blue","red"))

 

library(aplot)
library(ggplot2)
df<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap.csv",header=T)
df1<-reshape2::melt(df)
df1$value1<-ifelse(is.na(df1$value),0,df1$value)
df1$value1<-as.factor(df1$value1)
df1$A<-factor(df1$A,levels = rev(df$A))
p1<-ggplot(df1,aes(x=variable,y=A))+
  geom_tile(aes(fill=value1),color="black")+
  scale_fill_manual(values = c("white","orangered","red2","red4"))+
  scale_x_discrete(position = "top")+
  theme(panel.background = element_blank(),
        axis.title = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank(),
        axis.text.x.top = element_text(angle = 90,
                                       hjust = 0,
                                       vjust= 0.5),
        plot.title = element_text(hjust=0.5),
        legend.position = "none")+
  labs(title = expression(underline("Plant growth and development")))+
  geom_text(aes(label=value1,color=value1))+
  scale_color_manual(values = c("white","black","black","black"))



df2<-read.csv("example_data/ggplot2_heatmap_color_bar.csv",header=T)
df2$y<-factor(df2$y,levels = rev(df2$y))
p2<-ggplot(df2,aes(x=x,y=y))+
  geom_tile(aes(fill=group))+
  scale_x_continuous(expand = c(0,0))+
  theme(panel.background = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank(),
        axis.title = element_blank(),
        axis.text = element_blank(),
        legend.position = "left",
        legend.title = element_blank())+
  scale_fill_manual(values = c("green","blue","red"))

p1%>%
  insert_left(p2,width = 0.05)

 

这里遇到一个问题是如何将右侧的图例放大左上角去？用代码如何实现我暂时还不知道，出图以后手动编辑吧！

p3<-p1+
  theme(axis.text.y = element_blank())
pdf(file = "123.pdf",width = 12)
p1%>%
  insert_left(p2,width = 0.05)%>%
  insert_right(p3)%>%
  insert_right(p3)
dev.off()