circRNADisease数据库怎么用

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circRNA在生命活动中发挥着调控作用,在肿瘤等疾病中更是扮演着重要角色。circRNADisease是一个手工整理的疾病相关的环状RNA数据库,网址如下

http://cgga.org.cn:9091/circRNADisease/

目前该数据库中收录了330个circRNA,48种疾病,354个circRNA和疾病之间的关联数据。通过导航栏的Browser菜单，可以根据以下两种类型查看相关数据

1. circRNAs

2. Diseases

以肺癌为例，结果如下所示

该数据库中的环状RNA包括circBase id和circRNA name两种,对于每个环状RNA和疾病的关联数据,给出了检测的方式，环状RNA在患病者中的表达趋势，相关文献的pubmed id,点击details可以查看详细信息

1. circRNA  basic information

2. disease basic information

3. other information

通过该数据库，可以方便得到已经报导的环状RNA与疾病的关联数据。值得一提的是，所谓的环状RNA与疾病的关联，其实就是检测相比正常组织,患者组织中差异表达的环状RNA,方法包括转录组测序，芯片，qPCR等手段,只是一种简单的关联,并没有深入挖掘circRNA在疾病中的具体作用。

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