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源代码文件加密后，不影响软件的正常编译，合法用户正常双击打开，在授权范围内使用。源代码加密软件推荐使用德人合科技的透明加密防泄密软件系统，是一套从源头上保障数据安全和使用安全的软件系统。
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可能很长 ，这是在我以前一个程序里摘出来的。原理：用户输入创建密码，机器读取，并把每一位密码进行加密，这里就是把每一位的 ASCII码加一（也可以有其他的加密方式），然后保存在文件里。
常用简单的加密就是把字符移位，读取一个字符，将它+100，然后存为新文件中，解密时就读取-100，然后就是原文件了。还有就是读个字符和一个值异或，解密时还用这个加密的异或一遍，比较省力，一个方法就完成加解密了。
同时也需要对软件加密解密有细致的理解，比如流行的vmprotect、z壳以及早些年的upx壳、aspack等等。
按回车键结束，就会得到结果 如：uxx.y 下面是另一组输入输出：请输入密钥：35asjRYIRER！@#$^^*& 得到对应明文如下：+=4u#luhuDcFG((MI- 具体是如何加密，你应该能看懂，就是用一个三目运算符 ？ ：控制。
其实你这个加密和解密是一个可逆过程，用一个函数，就可以了，具体你想要的也不是太明白，就给你弄了一个简单一点加密和解密程序 ，输入输出不是同一个文件 ，不知道是不是你想要的。
/*数据只能是大写字母组成的字符串。加密的时候，输入Y，然后输入要加密的文本（大写字母）解密的时候，输入N，然后输入一个整数n表示密文的个数，然后n个整数表示加密时候得到的密文。
解密的时候，输入N，然后输入一个整数n表示密文的个数，然后n个整数表示加密时候得到的密文。
你去网上找一个 openssL 源代码，里面有常用算法的所有算法。你要找的RSA算法就包含在里面，除此之外，还有与证书相关的算法，以及多种对称密码算法。
开始Feistel结构的16次转换，第一次转换为：右侧数据R0和子密钥经过轮函数f生成用于加密左侧数据的比特序列，与左侧数据L0异或运算，运算结果输出为加密后的左侧L0，右侧数据则直接输出为右侧R0。
// C 语言 DES用的是 ECB模式， 没有填充 // 因此Java端要对应， 你的明文是 liubiao 吗？// 另外 DES已经不安全了， 如果可以改为 3DES或者 AES吧。
老实说，你这种写法有很大问题——有关stream大部分都是非托管，所以一定要记着Dispose，或Close（Close时会自动调用Dispose)。防止出现错误等内存泄露。
3DES加密过程为：C=Ek3(Dk2(Ek1(P)))3DES解密过程为：P=Dk1(EK2(Dk3(C)))具体的加/解密过程如图所示。
原理请参考： 加密技术01-对称加密-DES原理 3DES 三重数据加密算法(英语：Triple Data Encryption Algorithm，缩写为TDEA，Triple DEA)，或称3DES(Triple DES)，是一种对称密钥加密块密码，相当于是对每个数据块应用三次DES算法。
三重DES 在使用3TDES之前，用户首先生成并分配一个3TDES密钥K，它由三个不同的DES密钥K1，K2和K3组成。 详细可以看 Triple-DES 高级加密标准(Advanced Encryption Standard，AES)是目前比较流行和广泛采用的对称加密算法。