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1、文件系统在Linux系统中，分别为不同的应用安装单独的主分区将关键的分区设置为只读将大大提高文件系统的安全。这主要涉及到Linux自身的ext2文件系统的只添加（只添加）和不可变这两大属性。
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2、还有一个方法使“/etc/lilo.conf”更安全，那就是用chattr命令将其设为不可改：[root@kapil /]# chattr i /etc/lilo.conf 它将阻止任何对“lilo.conf”文件的更改，无论是否故意。关于lilo安全的更多信息，请参考LILO。
3、使用安全工具软件：Linux已经有一些工具可以保障服务器的安全。如bastille linux和Selinux。
root用户权限管理 root可谓是Linux重点保护对象，因为其权利是最高的，因此千万不要将它授权出去，但有些程序的安装、维护必须要求是超级用户权限，在此情况下，可以利用其他工具让这类用户有部分超级用户的权限。
方法如下：首先将主硬盘的数据线拆下，找一个10GB左右的硬盘挂在计算机上，将小硬盘设置为从盘，按照平常的操作安装Linux服务器版本，除了启动的引导程序放在MBR外，其它没有区别。 安装完成，调试出桌面后，关闭计算机。
例如，黑客可以利用finger服务查找用户的电话、使用目录以及其他重要信息。因此，很多Linux系统将这些服务全部取消或部分取消，以增强系统的安全性。
1合理选择Linux发行版本： 对于服务器使用的Linux版本，既不使用最新的发行版本，也不选择太老的版本。应当使用比较成熟的版本：前一个产品的最后发行版本如RHEL 0等。毕竟对于服务器来说安全稳定是第一的。
关闭系统不需要的服务Linux在安装完成后，绑定了很多没用的服务，这些服务默认都是自动启动的。对于服务器来说，运行的服务越多，系统就越不安全，越少服务在运行，安全性就越好，因此关闭一些不需要的服务，对系统安全有很大的帮助。
改进登录服务器将系统的登录服务器移到一个单独的机器中会增加系统的安全级别，使用一个更安全的登录服务器 来取代Linux自身的登录工具也可以进一步提高安全。在大的Linux网络中，最好使用一个单独的登录服务器用于syslog服务。
1、首先检查你的inetd.conf文件。inetd在某些端口上守侯，准备为你提供必要的服务。如果某人开发出一个特殊的inetd守护程序，这里 就存在一个安全隐患。
2、比如，如果我们要在Linux系统中查看Mysql的默认端口3306是否已经被计算机启动了，那么就可以使用命令“netstat -ntlp”进行查询。
3、首先需要在Linux终端输入指令：iptables -I INPUT -p tcp --dport 443 -j ACCEPT。回车之后继续输入指令，输入保存防火墙配置指令：service iptables save。确认之后，返回防火墙配置保存成功的提示信息。