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一、java web项目混淆
成都创新互联坚信：善待客户，将会成为终身客户。我们能坚持多年，是因为我们一直可值得信赖。我们从不忽悠初访客户，我们用心做好本职工作，不忘初心，方得始终。十多年网站建设经验成都创新互联是成都老牌网站营销服务商,为您提供网站设计制作、成都网站建设、网站设计、H5开发、网站制作、高端网站设计、小程序定制开发服务,给众多知名企业提供过好品质的建站服务。
proguard4.8工具，说是支持war的，可混淆过后少了classes目录了，自然成功不了。网上搜的过程不详说了，最后找着－－“J2EE-web工程ProGuard代码混淆07_28”，网址：
根据提示一步步完成。
把web项目打成jar包后用proguard进行混淆，然后把混淆过后的class目录替换发布包war中的对应目录，启动运行是正常的。
主要注意利用proguard生成xxx.pro文件，然后手动加工-keep class WebRoot.WEB-INFO.lib.* 等项目中不需要混淆的包和类。
二、java web项目打成.exe
没找到免费的，这搜到个收费的－－Jinstall，试了下功能挺好，
可以加密、集成jdk、tomcat，如果数据库是mysql也集成，其他数据库的话要设置数据库的url.
可以使用Virbox Protector Standalone 加壳工具对java的class类进行加密，支持各种开发语言的程序加密。可防止代码反编译，更安全，更方便
产品简介
Virbox Protector Standalone提供了强大的代码虚拟化、高级混淆与智能压缩技术，保护您的程序免受逆向工程和非法修改。
Virbox Protector Standalone 将被保护的程序代码转换为虚拟机代码，程序运行时，虚拟机将模拟程序执行，进入和离开虚拟机都有高级代码混淆。虚拟机配合代码混淆可以达到很好的保护效果，尤其是开发者的私有逻辑。高级混淆利用花指令和代码非等价变形等技术，将程序的代码，转换成一种功能上等价，但是难于阅读和理解的代码，可充分干扰静态分析。应用程序的解压缩含有动态密码，让一切自动脱壳工具失效，有效的阻止.Net、PE 程序的直接反编译。
特点
多种加密策略：代码虚拟化、高级混淆、智能压缩
性能分析：智能分析引擎，一键分析各个函数模块调用的次数
支持多种开发语言：多种开发语言加壳支持
源码级保护：保护到汇编级别，c#保护IL级别
免费更新：免费版本升级
可以的。推荐的是使用绿盾加密，采用的是文件透明加密模块，对平常办公使用是没有影响的。而且绿盾支持与SVN等源代码管理工具无缝结合。
如果企业内部SVN服务器采取透明模式，即加密文件是可以存放在SVN服务器上的，需要达到的效果是SVN服务器上文件密文存储。则配合天锐绿盾应用服务器安全接入系统来实现只有安装了加密客户端的Windows、Linux、MAC端才能够正常的访问公司内部的SVN服务器。
如果企业内部采用eclipse、VS等开发工具，从这些开发工具将代码直接上传到SVN服务器上时会自动解密。为了避免明文、密文混乱存放导致版本比对时出现错误等问题。因此，SVN服务器上需统一存放明文文件。则通过服务器白名单功能实现对终端电脑数据进行强制透明加密，对上传到应用服务器数据实现上传自动解密、下载自动加密。再配合天锐绿盾应用服务器安全接入系统实现只有安装了加密客户端的Windows、Linux、MAC端才能够正常的访问公司内部的SVN服务器。
赛虎信息科技始终倾力为企事业单位的信息安全、绿盾数据防泄密提供一体化顾问式解决方案，为客户提供优质的内网安全管理产品和适合多种行业的应用解决方案。