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(run1.sh ) ; 码派(run2.sh 孙携) ; (run3.sh)
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如则模伏果还有继续加
最近，有一批任务需要把两批的fastq合并到一起并压缩成一个fastq文件才能继续往下做，由于存储空间有限又不能直接全部跑上，只能按样本逐个分批跑。众所周知，一般fastq是成对存在的，所需要对read1和read2分别合并一次，然而这次任务的fastq文件比较大，合并然后压缩一次需要1天左右，那对于一组fastq就要2-3天，这也太耗时间了，所以我在想能不能read1和read2 同时跑上，这就可以节省一半的时间了。
平时也能遇到很多类似的任务，特别是在进程数有限的情况下，如果这些小任务单独占用一个进程，而任务很多就很耗时间，如果能在一个进程下实现多个线程并行执行，就能大大提高运行效率。关于进程和线程的知识可以参考知乎的这篇文章【 Shell“ 多线程”，提高工作效率 】，整理的也比较有条理，能比较容易读懂。
当然，某些博主也写过类似的文章，例如这篇【 shell后台限制多并发控制后台任务强度进行文件拷贝 】但是实在是太高深莫测了，看不懂，一时半会儿也学不会。本文将示例Shell实现多线程的简单版本，其实不用太复杂。
其实只需要两个步骤， 第一步是给需要并行运行的命令行在结尾加上""，代表放到后台运行，第二步是在在所有并行任务的后面加上一句“wait”，意思是等所有通过“”放到后台运行的任务跑完后再继续执行后面的任务 ，这些就能实现所有带有“”的行并行执行了。
看完脚本是不是觉得很简单？
上面的脚本适合并行任务少的，可以手弊陵粗动加和wait，但是如果有几十个甚至上百个的小任务就租镇比较麻烦了。但不用担心，可以写个循环，批量运行。
循环的结果也是跟上面类似的，只是多了个循环结构。
如果需要执行的任务只有一行，可以把大括号去掉。
关于for和while的循环可以查看之前的文章【 Shell常用循环示例（for和while批量汪宽处理）2022-05-25 】
需要注意的是多线程并行还是需要有限制的，毕竟都是在一个进程里运行，如果线程太多了会卡顿的，建议控制在100个以内，当然还有毕竟高级和复杂的方法可以实现限制。因为上面的脚本已经够我用了，没继续往下学，以后可以再补充。
Linux 如何运行benchmark循环跑如下
benchmark中包含了跑benchmark的源码benchncnn.cpp，感兴趣的可以先看一下里面的内容。在Linux的文件根目录下，新建一个build文件夹并进入，当然也可以不叫build，随便你自己起。mkdir build cd build进入之后就可以进行编译了，编译之后者拆衡在build文件夹下会生成一个叫benchmark的文件夹，之后的工作会在这里进行。编首做译用的是cmake，这里如果有问题的话可以注意一下cmake的版本，我用的版本是3.12.3。具体命令如下:cmake .
make -j8这里cmake编译实际上是要根据上一层文件夹的CMakeLists.txt的文本来的，这里的..其实就是表示的上一层文件夹。 Make -j后面的数字是开几个核，根据自己电脑的实际情况来。执行完成之后就可以看到build里有了benchmark的文件夹。
入这个文件夹，可以看到一个benchncnn的可执行文件已经编译好了，运行这个可执行文件就可以测试模型的速度。但是这个可执行文件默认的是找到当前文件夹下的param格式的文件。
所有自带的模型文件都在ncnn根目录下的benchmark的文件夹中，把里面所有的param文件都拷贝到现在的benchmark文御轮件夹，然后执行如下命令./benchncnn 4 2 0 -1
第一个数字表示测试次数，第二个表示开的线程数（这一点ncnn做的不错），最后一个数字-1表示只测cpu。NCNN交叉编译到rk3288(armv7架构)和rk3399(armv8架构）的方法。