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首先，命令应该是好和其他两个区分开来的了，因为命令都是可以直接敲在shell上面回车执行的，而系统调用和库函数都不行；
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其次，百Linux系统调用和C库函数都是函数的形式，即都是“func(args)”的形式，但系统调用是
由系统内核对外提供的服务接口；C库函数和你自己写的普通的函数没有本质的区别，只是在度C标准库中而已，Linux上面glibc就是C函数库。从表专面上看两者不太好区分，不过，你可以从它们需要包含的头文件来区分，C库函数像printf在stdio.h中，std就是标准（standard)的缩写形式，因此在stdxxx.h中的函数，基本都是C库函数；像
ssize_t
read(int
fd,
void
*buf,
size_t
count);这样很多的系统调用是包含在unistd.h中的，unistd意思是UNIX
Standard，从这个意义就可以区分了。
希望对你有所帮助，如还有问题，可随属时联系我:-)
Linux编程中在命令行启动另一个可执行文件或调用命令用system函数最简单了，这个函数原理是在你编写的那个程序的内部启动另一个程序或命令，从而创建一个新进程，并等待这个进程执行完毕退出。如果正常执行，system函数将返回被执行程序或命令的退出码；如果无法运行这个程序或命令，将返回错误代码127；如果是其他错误，返回-1。这个函数的原型是：
#include stdlib.h
int system(const char *string);
参数string是将要执行的程序文件名或路径，如果是启动一个命令就是一个命令字符串。
还有一种执行外部程序的方法是exec系列函数，一般是在fork的子进程里面调用exec系列函数，那主进程里直接调用exec系列不行吗，为什么要fork再在子进程里调用呢？因为exec系列的函数（包括execl函数）都是将当前进程替换成新进程，也就是说新进程启动后原来的进程就不存在了，exec系列函数后面的那些代码就不会再执行了。如果你不放在fork子进程里面，那主进程在执行execl函数后就完全不存在了，所以exec系列函数的使用都是先fork然后在子进程里面调用。因为exec系列函数都要使用fork调用，所以我一般是用system函数。
Linux系统中的命令实在是太多了，简单包括两类命令，一类是内部命令，指的是Shell自身提供的功能，一类是外部命令，指的是第三方的控制台应用程序。
一般来说，没必要完全学习所有的命令，大体上有个印象，用到的时候去查一下帮助文档，久而久之，自然熟练。
下面是网友整理的20个最常用的Linux命令：
1. ls命令
ls命令是列出目录内容(List Directory Contents)的意思。运行它就是列出文件夹里的内容，可能是文件也可能是文件夹。
2. lsblk命令
"lsblk"就是列出块设备。除了RAM外，以标准的树状输出格式，整齐地显示块设备。
3. md5sum命令
“md5sum”就是计算和检验MD5信息签名。md5 checksum(通常叫做哈希)使用匹配或者验证文件的文件的完整性，因为文件可能因为传输错误，磁盘错误或者无恶意的干扰等原因而发生改变。
4. dd命令
“dd”命令代表了转换和复制文件。可以用来转换和复制文件，大多数时间是用来复制iso文件(或任何其它文件)到一个usb设备(或任何其它地方)中去，所以可以用来制作USB启动器。
6. history命令
“history”命令就是历史记录。它显示了在终端中所执行过的所有命令的历史。
7. sudo命令
“sudo”(super user do)命令允许授权用户执行超级用户或者其它用户的命令。通过在sudoers列表的安全策略来指定。
8. mkdir命令
“mkdir”(Make directory)命令在命名路径下创建新的目录。然而如果目录已经存在了，那么它就会返回一个错误信息"不能创建文件夹，文件夹已经存在了"("cannot create folder, folder already exists")
9. touch 命令
“touch”命令代表了将文件的访问和修改时间更新为当前时间。touch命令只会在文件不存在的时候才会创建它。如果文件已经存在了，它会更新时间戳，但是并不会改变文件的内容。
10. chmod 命令
“chmod”命令就是改变文件的模式位。chmod会根据要求的模式来改变每个所给的文件，文件夹，脚本等等的文件模式（权限）。
11. chown命令
“chown”命令就是改变文件拥有者和所在用户组。每个文件都属于一个用户组和一个用户。在你的目录下，使用"ls -l",你就会看到像这样的东西。
12. apt命令
Debian系列以“apt”命令为基础，“apt”代表了Advanced Package Tool。APT是一个为Debian系列系统（Ubuntu，Kubuntu等等）开发的高级包管理器，在Gnu/Linux系统上，它会为包自动地，智能地搜索，安装，升级以及解决依赖。
13. tar命令
“tar”命令是磁带归档(Tape Archive)，对创建一些文件的的归档和它们的解压很有用。
14. cal 命令
“cal”（Calender），它用来显示当前月份或者未来或者过去任何年份中的月份。
16. cat命令
“cat”代表了连结（Concatenation），连接两个或者更多文本文件或者以标准输出形式打印文件的内容。
17. cp 命令
“copy”就是复制。它会从一个地方复制一个文件到另外一个地方。
18. mv 命令
“mv”命令将一个地方的文件移动到另外一个地方去。
19. pwd 命令
“pwd”（print working directory），在终端中显示当前工作目录的全路径。
20. cd 命令
最后，经常使用的“cd”命令代表了改变目录。它在终端中改变工作目录来执行，复制，移动，读，写等等操作。