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分层就是把代码按照逻辑，分成多个不同的层次。
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分层的目的是让结构更清晰，代码编写的时候也更好管理。
比如三层的MVC，分为model业务层，view展示层，control控制层。
更个部分的代码相对独立，层次的关系也很明了。有的会把model层再细分。。。
代码详解就算了吧。
你了解这个还是通过项目了解的好，这种分层思想也是从实际工作中总结出来的。不是凭空想象的、。
基本的分层，就是mvc，你可以查一下这方面的资料，当然，根据需要也有不同的分层思路，比如有的项目重效率，有的项目重流程，侧重点不同，所以分的层次不同但基本的就是mvc了，然后在往上面延伸，出现了什么业务层之类的……
表现层
jsp：页面渲染
servlet：接收用户数据（）调用业务，接收业务传来的数据，页面跳转，传递数据。
业务层
service：接受servlet传入数据，进行业务规则处理，调用dao，接受dao返回的数据，向servlet返回数据。
持久化层
dao：接受业务传入数据，进行对数据库进行增删改查，得到的数据向业务层返回。
MVC模式。
Model模式层
View视图层
Controller控制器
视图(View)代表用户交互界面，对于Web应用来说，可以概括为HTML界面，但有可能为XHTML、XML和Applet。随着应用的复杂性和规模性，界面的处理也变得具有挑战性。一个应用可能有很多不同的视图，MVC设计模式对于视图的处理仅限于视图上数据的采集和处理，以及用户的请求，而不包括在视图上的业务流程的处理。业务流程的处理交予模型(Model)处理。比如一个订单的视图只接受来自模型的数据并显示给用户，以及将用户界面的输入数据和请求传递给控制和模型。
模型(Model)：就是业务流程/状态的处理以及业务规则的制定。业务流程的处理过程对其它层来说是黑箱操作，模型接受视图请求的数据，并返回最终的处理结果。业务模型的设计可以说是MVC最主要的核心。目前流行的EJB模型就是一个典型的应用例子，它从应用技术实现的角度对模型做了进一步的划分，以便充分利用现有的组件，但它不能作为应用设计模型的框架。它仅仅告诉你按这种模型设计就可以利用某些技术组件，从而减少了技术上的困难。对一个开发者来说，就可以专注于业务模型的设计。MVC设计模式告诉我们，把应用的模型按一定的规则抽取出来，抽取的层次很重要，这也是判断开发人员是否优秀的设计依据。抽象与具体不能隔得太远，也不能太近。MVC并没有提供模型的设计方法，而只告诉你应该组织管理这些模型，以便于模型的重构和提高重用性。我们可以用对象编程来做比喻，MVC定义了一个顶级类，告诉它的子类你只能做这些，但没法限制你能做这些。这点对编程的开发人员非常重要。
业务模型还有一个很重要的模型那就是数据模型。数据模型主要指实体对象的数据 保存（持续化）。比如将一张订单保存到数据库，从数据库获取订单。我们可以将这个模型单独列出，所有有关数据库的操作只限制在该模型中。
控制(Controller)可以理解为从用户接收请求, 将模型与视图匹配在一起，共同完成用户的请求。划分控制层的作用也很明显，它清楚地告诉你，它就是一个分发器，选择什么样的模型，选择什么样的视图，可以完成什么样的用户请求。控制层并不做任何的数据处理。例如，用户点击一个连接，控制层接受请求后, 并不处理业务信息，它只把用户的信息传递给模型，告诉模型做什么，选择符合要求的视图返回给用户。因此，一个模型可能对应多个视图，一个视图可能对应多个模型。
模型、视图与控制器的分离，使得一个模型可以具有多个显示视图。如果用户通过某个视图的控制器改变了模型的数据，所有其它依赖于这些数据的视图都应反映到这些变化。因此，无论何时发生了何种数据变化，控制器都会将变化通知所有的视图，导致显示的更新。这实际上是一种模型的变化-传播机制。模型、视图、控制器三者之间的关系和各自的主要功能，如图1所示。
不仅仅是Java开发
其它很多编程语言也是需要分层开发的
分层一个是为了解耦
另一个是提高开发效率，能够实现不同的部分同时开发
com.action一般你的网站是action.com才这样命名的
dao一般是存放和数据库打交道的接口
daoImpl一般是放dao里面那些接口的实现的
没有统一的模板，不同项目，不同架构师出来的可能都不一样。